MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE02

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010724	TGAA	2	8	14	21	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010724	GTG	2	6	38	43	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010724	TAA	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010724	T	7	7	73	79	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010724	AT	3	6	81	86	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010724	A	7	7	102	108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010724	GGA	3	9	109	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010724	A	6	6	132	137	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
9	NC_010724	A	7	7	146	152	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
10	NC_010724	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
11	NC_010724	A	6	6	292	297	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
12	NC_010724	TCC	2	6	303	308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188587526
13	NC_010724	TTCC	2	8	311	318	0 %	50 %	0 %	50 %	188587526
14	NC_010724	AGC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188587526
15	NC_010724	GAAA	2	8	359	366	75 %	0 %	25 %	0 %	188587526
16	NC_010724	ATAAA	2	10	385	394	80 %	20 %	0 %	0 %	188587526
17	NC_010724	AGA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
18	NC_010724	AAG	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
19	NC_010724	ACC	2	6	450	455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188587526
20	NC_010724	GAAA	2	8	465	472	75 %	0 %	25 %	0 %	188587526
21	NC_010724	ATT	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587526
22	NC_010724	GA	3	6	539	544	50 %	0 %	50 %	0 %	188587526
23	NC_010724	AGT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587526
24	NC_010724	GA	3	6	666	671	50 %	0 %	50 %	0 %	188587526
25	NC_010724	CG	3	6	817	822	0 %	0 %	50 %	50 %	188587526
26	NC_010724	ATA	2	6	840	845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587526
27	NC_010724	GAG	2	6	902	907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587526
28	NC_010724	AT	3	6	926	931	50 %	50 %	0 %	0 %	188587526
29	NC_010724	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
30	NC_010724	AAT	2	6	993	998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587526
31	NC_010724	AGT	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587526
32	NC_010724	AGG	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010724	A	6	6	1128	1133	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
34	NC_010724	A	7	7	1146	1152	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
35	NC_010724	GA	3	6	1199	1204	50 %	0 %	50 %	0 %	188587527
36	NC_010724	AGA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587527
37	NC_010724	A	6	6	1275	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
38	NC_010724	A	6	6	1284	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
39	NC_010724	TAAGTA	2	12	1316	1327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188587527
40	NC_010724	A	6	6	1344	1349	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
41	NC_010724	CAA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587527
42	NC_010724	A	7	7	1429	1435	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
43	NC_010724	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587527
44	NC_010724	GAT	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587527
45	NC_010724	TCA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587527
46	NC_010724	CAG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188587527
47	NC_010724	TCA	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587528
48	NC_010724	AG	3	6	1842	1847	50 %	0 %	50 %	0 %	188587528
49	NC_010724	ATT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587528
50	NC_010724	TTTA	2	8	1918	1925	25 %	75 %	0 %	0 %	188587528
51	NC_010724	TA	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	188587528
52	NC_010724	AAC	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587528
53	NC_010724	GGT	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587528
54	NC_010724	TAA	2	6	2154	2159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587528
55	NC_010724	TAT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587528
56	NC_010724	AAC	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587528
57	NC_010724	AGG	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587528
58	NC_010724	TCC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010724	AC	4	8	2429	2436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010724	TG	3	6	2442	2447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010724	TAA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010724	ATA	2	6	2477	2482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010724	AGA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
64	NC_010724	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587529
65	NC_010724	GTG	2	6	2691	2696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587529
66	NC_010724	AT	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	188587529
67	NC_010724	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
68	NC_010724	A	6	6	2796	2801	100 %	0 %	0 %	0 %	188587529
69	NC_010724	AGA	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
70	NC_010724	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
71	NC_010724	AGA	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
72	NC_010724	ACAA	2	8	2926	2933	75 %	0 %	0 %	25 %	188587529
73	NC_010724	AGA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
74	NC_010724	ATA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587529
75	NC_010724	A	6	6	3009	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	188587529
76	NC_010724	CAA	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010724	TAAC	2	8	3102	3109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010724	A	6	6	3174	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010724	A	8	8	3228	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
80	NC_010724	A	7	7	3263	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
81	NC_010724	ACT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587530
82	NC_010724	A	6	6	3375	3380	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
83	NC_010724	GAAA	2	8	3393	3400	75 %	0 %	25 %	0 %	188587530
84	NC_010724	AGA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587530
85	NC_010724	A	6	6	3411	3416	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
86	NC_010724	GCT	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188587530
87	NC_010724	AAAGG	2	10	3582	3591	60 %	0 %	40 %	0 %	188587530
88	NC_010724	AT	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	188587530
89	NC_010724	AAG	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587530
90	NC_010724	TA	3	6	3742	3747	50 %	50 %	0 %	0 %	188587530
91	NC_010724	AGG	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010724	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587531
93	NC_010724	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587531
94	NC_010724	GGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587531
95	NC_010724	A	6	6	3831	3836	100 %	0 %	0 %	0 %	188587531
96	NC_010724	GGA	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587531
97	NC_010724	A	6	6	3873	3878	100 %	0 %	0 %	0 %	188587531
98	NC_010724	TAAA	2	8	3999	4006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010724	A	7	7	4004	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010724	AT	3	6	4110	4115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010724	CTC	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010724	GAG	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010724	A	6	6	4289	4294	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
104	NC_010724	A	6	6	4317	4322	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
105	NC_010724	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
106	NC_010724	CAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
107	NC_010724	AGA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587532
108	NC_010724	TAA	2	6	4607	4612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587532
109	NC_010724	A	6	6	4617	4622	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
110	NC_010724	TGGT	2	8	4628	4635	0 %	50 %	50 %	0 %	188587532
111	NC_010724	ATAAA	2	10	4747	4756	80 %	20 %	0 %	0 %	188587532
112	NC_010724	A	6	6	4754	4759	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
113	NC_010724	CAA	2	6	4785	4790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
114	NC_010724	TCA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587532
115	NC_010724	AG	3	6	4982	4987	50 %	0 %	50 %	0 %	188587532
116	NC_010724	ATT	2	6	4996	5001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
117	NC_010724	TTTA	2	8	5058	5065	25 %	75 %	0 %	0 %	188587532
118	NC_010724	TA	3	6	5112	5117	50 %	50 %	0 %	0 %	188587532
119	NC_010724	AAC	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
120	NC_010724	GGT	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587532
121	NC_010724	TAA	2	6	5294	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587532
122	NC_010724	TAT	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
123	NC_010724	AAC	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
124	NC_010724	AGG	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587532
125	NC_010724	TCC	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010724	TGA	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010724	A	6	6	5559	5564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010724	ATAAA	2	10	5570	5579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010724	TAAA	2	8	5611	5618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010724	GTGA	2	8	5654	5661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010724	AAG	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010724	CCTTTT	2	12	5690	5701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010724	CTT	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010724	AGG	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010724	T	6	6	5825	5830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010724	TCA	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587533
137	NC_010724	ATT	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
138	NC_010724	A	7	7	5952	5958	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
139	NC_010724	AAC	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587533
140	NC_010724	TAT	2	6	6028	6033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
141	NC_010724	TCA	2	6	6066	6071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587533
142	NC_010724	GAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
143	NC_010724	T	6	6	6173	6178	0 %	100 %	0 %	0 %	188587533
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.